"Зв'язуючи долю з сестрами Амаґамі"- це романтичне комедійне аніме, що розповідає про Урю Каміхате, старшокласника, який прагне вступити на медичний факультет Кіотського університету. Провівши більшу частину свого дитинства в сиротинці після смерті матері, Урю переїжджає жити до храму Амагамі, де стикається з унікальною ситуацією: головний священик просить його одружитися з однією з трьох своїх онучок.
Пристосовуючись до життя в храмі, Урю налагоджує стосунки з сестрами Амагамі, кожна з яких має свій характер і свої проблеми. Оповідь досліджує їхню взаємодію, коли вони вирішують різні проблеми, включно з фінансовими труднощами, що загрожують існуванню святині. Через флешфорварди з'являється припущення, що Урю судилося одружитися з однією з сестер, що додає сюжету романтичного напруження.