"Під мостом над Аракавою" розповідає історію Коу Ічіномії, успішного бізнесмена, який пишається тим, що ніколи нікому не заборгував. Однак одного разу, коли він падає в річку Аракава, його рятує бездомна дівчина на ім'я Ніно, і згодом він змушений стати її коханцем.
Коу опиняється під мостом Аракава, у химерній спільноті диваків і невдах. Пристосовуючись до нового життя, він зустрічає безліч унікальних персонажів, серед яких каппа, черниця з пістолетом, чоловік із зіркою на обличчі та чоловік, одягнений як Венера.
Взаємодіючи з цими ексцентричними особистостями, Коу починає ставити під сумнів власні цінності та переконання, відкриваючи для себе важливість людських зв'язків і красу нетрадиційного життя. Поряд із гумористичними та зворушливими моментами, серіал заглиблюється у глибші теми самопізнання, прийняття та значення особистих стосунків.
Мандруючи дивакуватою та подекуди сюрреалістичною спільнотою "Під мостом над Аракавою", Коу поступово вчиться відпускати свій суворий і жорсткий світогляд, зрештою знаходячи себе та справжній сенс життя у найнесподіванішому місці.