У другому сезоні "Код: Руйнівник" Сакура стає свідком жорстокого вбивства кількох "зламувачів коду". Вона сповнена рішучості розкрити правду про ці вбивства та корупцію в організації. Заглиблюючись у темні таємниці, Сакура укладає союз із таємничим Code:Breaker на ім'я Токі, який володіє здатністю маніпулювати часом. Разом вони вирушають у небезпечну подорож, борючись з іншими могутніми зломщиками коду та відкриваючи шокуючі таємниці про природу своїх здібностей. У міру того, як розкривається правда, дружба Сакури і Токі міцнішає, і їм доводиться зіткнутися з власним минулим, намагаючись переписати майбутнє. Посеред запеклих битв та емоційних потрясінь вони прагнуть відновити справедливість і баланс у світі, що потерпає від темряви та корупції. Чи досягнуть вони успіху у своїх пошуках, чи будуть поглинуті владою, якою володіють?