"Брубейкер" розповідає історію Генрі Брубейкера, новопризначеного наглядача в'язниці Вейкфілд в Арканзасі, який розпочинає місію з реформування корумпованої та жорстокої пенітенціарної системи. Маскуючись під в'язня, Брубейкер занурюється у в'язничне середовище, щоб викрити повсюдні зловживання та системну корупцію, які пронизують установу. Прибувши на місце, він на власні очі бачить жахливі умови життя, включаючи недостатнє харчування, нестримне насильство та експлуатацію ув'язнених. Розкриваючи свою справжню особистість як ув'язненим, так і персоналу, він стикається зі значним опором корумпованих чиновників, які наживаються на поганому управлінні в'язницею. Зусилля Брубейкера, спрямовані на впровадження реформ, наштовхуються на ворожість, оскільки він кидає виклик статус-кво, прагнучи покращити ставлення до ув'язнених і повернути їм гідне життя. Під час свого перебування на посаді Брубейкер відкриває похмуру таємницю, пов'язану з безіменними могилами ув'язнених, які вважалися зниклими безвісти або втекли. Це одкровення приводить його до морального конфлікту з тюремною адміністрацією, яка намагається приховати правду. Заглиблюючись у корупцію, він стикається з могутніми супротивниками, які прагнуть зберегти свій контроль над установою. Зрештою, Брубейкер досліджує теми справедливості, спокути та боротьби проти системного гноблення, що завершується потужним коментарем про необхідність тюремної реформи та підзвітності в системі правосуддя.