У "Мінлива хмарність, часом фрикадельки 2" винахід Флінта Локвуда, FLDSMDFR, все ще спричиняє хаос, створюючи гібриди їжі та тварин. Флінта та його друзів запрошують приєднатися до компанії "Лайв Корп", якою керує його кумир Честер В. Їм доручають очистити острів Ластівчин водоспад, який заполонили їстівні тварини. Прибувши на місце, Флінт виявляє, що його FLDSMDFR все ще працює і створює гігантських харчових істот, схожих на тварин. Поки група намагається вирішити проблему, вони стикаються з численними вигадливими їстівними істотами, включаючи креветок, такодилів і сирних павуків. По дорозі Флінтові допомагає його дитяче кохання Сем Спаркс, який допомагає йому впоратися з труднощами і розкрити прихований мотив Честера викрасти FLDSMDFR. Завдяки командній роботі та винахідливості вони рятують ситуацію, вимикаючи машину і зберігаючи природний баланс водоспаду Ластівка. Флінт усвідомлює важливість своїх справжніх друзів і силу відповідального використання науки. Через низку веселих і зворушливих пригод "Мінлива хмарність, часом фрикадельки 2" нагадує нам про важливість дружби, чесності та наслідки неконтрольованих амбіцій.