"Сталевий Алхімік: Завойовник Шамабали" розгортається в Мюнхені, Німеччина, і починається там, де закінчився серіал. Історія розповідає про братів Елріків, Едварда та Альфонса, які шукають спосіб повернутися у свій власний світ. Успішно закривши Браму Істини та пожертвувавши своїми алхімічними здібностями, вони опиняються в паралельному всесвіті, що дуже нагадує земну епоху 1920-х років.
У цьому світі Едвард стикається з таємничою організацією, відомою як Товариство Туле, яка прагне використати силу алхімії для своїх зловісних цілей. Тим часом Альфонс знайомиться з дівчиною на ім'я Ноа, яка має зв'язок з Товариством Туле і володіє цінною інформацією про невловиме місто Шамбала.
Досліджуючи товариство, Едвард дізнається, що його члени намагаються відкрити Ворота Істини, щоб отримати доступ до необмеженої влади. За допомогою друзів з обох світів Едвард і Альфонс повинні зупинити плани Товариства Туле і знайти спосіб повернутися додому, і все це в той час, коли вони стикаються з особистими демонами і примиряються з наслідками своїх минулих вчинків.
"Сталевий Алхімік: Завойовник Шамабали" заглиблюється в теми ідентичності, жертовності та наслідків неконтрольованих амбіцій. Фільм досліджує паралельні світи алхімії, війни та технологій, переплітаючи історичні події та персонажів з фантастичними елементами всесвіту Сталевий Алхімік. Завдяки захоплюючій анімації та напруженим екшн-сценам брати Елрік вирушають у захопливу пригоду, яка кидає виклик їхнім переконанням, випробовує їхню рішучість і врешті-решт приводить їх до протистояння з істинною природою Шамбали та таємницею самої алхімії.