У кіберпанковому майбутньому, де людство злилося з технологіями, майор Мотоко Кусанаґі очолює елітний спецпідрозділ 9, що бореться з кібертероризмом. Їхньою останньою справою займається Лялькар, сумнозвісний хакер, який може проникати в людську свідомість. Заглиблюючись у справу, Майор ставить під сумнів власну людяність і природу свідомості, що призводить до філософської подорожі, яка розмиває межі між людиною і машиною.