На далекій планеті Криптон Джор-Ел, високоінтелектуальний вчений, відправляє свого новонародженого сина Кал-Ела на Землю, оскільки їхній планеті загрожує неминуче знищення. Кал-Ел приземляється в Смолвілі, штат Канзас, де його знаходять і виховують Джонатан і Марта Кент як свого прийомного сина Кларка. Коли Кларк підростає, він починає відкривати в собі надзвичайні здібності, включаючи надлюдську силу і здатність літати.
Подорож Кларка до розуміння своїх здібностей приводить його до знахідки стародавнього криптоніанського корабля, похованого в Арктиці. Там він зустрічає голографічну проекцію свого біологічного батька, який пояснює його справжнє походження і закликає Кларка прийняти свою долю. Озброєний криптоніанським костюмом і новознайденим почуттям мети, Кларк приймає образ Супермена і переїжджає до Метрополісу, міста, яке відчайдушно потребує героя.
Тим часом безжалісний криптоніанський генерал Зод, який намагався здійснити переворот на Криптоні перед його знищенням, вистежує Кал-Ела на Землі. Зод і його послідовники вимагають, щоб людство видало Кал-Ела, не знаючи, що він тепер Супермен. Коли їхні вимоги відхиляють, Зод сіє хаос у Метрополісі, присягаючись знищити людство і відбудувати на Землі Криптон.
Супермен стикається зі своїм першим справжнім випробуванням - він бореться із Зодом та його армією, спричиняючи масові руйнування. Коли місто руйнується навколо нього, Супермен повинен зробити складний вибір: вбити Зода, щоб врятувати життя невинних людей, або знайти альтернативне рішення. У кульмінаційній сутичці Супермен зрештою перемагає Зода, але спустошений втратою власного народу і руйнуванням, яке він ненавмисно спричинив.
Фільм закінчується тим, що Супермен присягається захищати Землю та її людей, вчиться контролювати свої сили і приймає свою роль символу надії. Світ тепер знає про надзвичайного героя, який захистить його від будь-яких загроз, що можуть виникнути, і Супермен готовий зустріти будь-які виклики, що чекають на нього в майбутньому.