"Місія: Нездійсненна 4 – Протокол Фантом" розповідає про Ітана Ханта та його команду, яких звинувачують у підготовці вибуху в Кремлі в Росії. Цей інцидент змушує уряд США дезавуювати весь загін IMF (Сили нездійсненних місій). Не маючи офіційної підтримки та ресурсів, Ітан та його команда, до якої входять агенти Джейн, Бенджі та Брандт, змушені піти на злочин, щоб очистити свої імена та запобігти глобальній катастрофі.
Їхня місія проходить через різні екзотичні місця, від Дубаї до Мумбаї, де вони намагаються зупинити ядерного екстреміста Курта Гендрікса, який намагається розв'язати глобальну ядерну війну. Команда стикається з численними викликами та небезпечними зустрічами, включаючи захоплюючу сцену, в якій Ітан піднімається на найвищу будівлю у світі - Бурдж-Халіфу.
Команда стикається з невдачами та зрадою, тому мусить покладатися на свій розум, навички та один на одного, щоб перехитрити ворогів і запобігти руйнівним наслідкам плану Гендрікса. На своєму шляху вони зустрічають як союзників, так і ворогів, долаючи павутиння подвійних підступів і мінливих лояльностей.
Коли час спливає, а світ стоїть на межі знищення, Ітан і його команда повинні вистежити і зупинити Гендрікса, поки не стало надто пізно. Фільм завершується відповідальною місією з проникнення в Кремль для отримання важливої інформації, яка перевіряє здібності команди та її рішучість знищити небезпечного терориста.
У фільмі "Місія: Нездійсненна 4 – Протокол Фантом" МВФ стикається з найскладнішою місією, яка змушує команду працювати на межі своїх можливостей, щоб врятувати світ і відновити репутацію своєї агенції. Завдяки захоплюючим екшн-сценам, хитромудрому сюжету та неочікуваним поворотам, фільм тримає в напрузі від початку і до кінця.