У 23 столітті капітан Джеймс Т. Кірк разом з екіпажем корабля "Зоряний шлях: Покоління" вирушає у подорож, щоб врятувати ель-ауріанських біженців з таємничої енергетичної стрічки, відомої як Нексус. Однак під час місії "Ентерпрайз" зазнає серйозних пошкоджень, внаслідок чого Кірк зникає безвісти і вважається загиблим.
Вісімдесят років потому зореліт "Ентерпрайз-Д" під командуванням капітана Жана-Люка Пікара розслідує руйнування обсерваторії Амаргоса. Вони знаходять вченого на ім'я доктор Соран, який одержимий ідеєю повернутися до Нексусу і досягти вічного щастя. Пікар дізнається, що Соран планує змінити траєкторію руху сусідньої зірки, щоб наблизити енергетичну стрічку настільки, щоб увійти в неї.
Пікар повинен зупинити руйнівні плани Сорана і врятувати мільйони життів. Під час протистояння Пікар опиняється в пастці в Нексусі, ідилічному світі, де час не має значення. Там він зустрічає Кірка, який живе в Нексусі після своєї нібито смерті. Два капітани об'єднують зусилля, щоб втекти з Нексусу і не дати Сорану змінити курс зірки.
Під час битви Кірк жертвує собою, щоб врятувати Пікарда і покласти край планам Сорана. Пікард оплакує втрату свого попередника, але надихається мужністю і рішучістю Кірка. Екіпаж "Зоряний шлях: Покоління" шанує пам'ять Кірка, а Пікар продовжує керувати своїм екіпажем, знаючи, що спадщина капітана Джеймса Т. Кірка ніколи не буде забута.