Цей мультсеріал пропонує свіжий погляд на Черепашок-ніндзя. Леонардо, Рафаель, Донателло та Мікеланджело - чотири брати, які перетворюються на людиноподібних черепашок після контакту з таємничою рідиною. Разом зі своїм щурячим сенсеєм, майстром Сплінтером, вони відточують навички ніндзюцу у прихованих каналізаційних колекторах Нью-Йорка. Ці відважні черепахи стають захисниками міста, протистоячи химерним мутантам, зловмисним прибульцям і жадібному до влади Шреддеру, який не зупиниться ні перед чим, щоб досягти свого глобального завоювання.