У дев'ятому сезоні "Анатомії Грей" лікарню Грейс Мерсі Вест у Сіетлі перейменовують на Меморіальну лікарню Грей Слоун на честь її загиблих героїв. Лікарі стикаються з наслідками авіакатастрофи, деякі з них справляються краще за інших. Мередіт бореться з почуттям провини за те, що вижила, а Крістіна намагається відновити свою впевненість в операційній.
Дерек стикається з новими лікарями, в тому числі з конкурентною докторкою Аланою Кехілл, яку привезли для реструктуризації лікарні. Відносини піддаються випробуванню, коли Келлі та Арізона намагаються відновити свій шлюб після аварії, а Ейпріл розривається між двома залицяльниками.
Тим часом до лікарні приєднується нова група інтернів, що додає свіжої енергії команді. Вони стикаються з власними особистими та професійними викликами, орієнтуючись у світі хірургії, що перебуває під високим тиском.
З початком сезону лікарі стикаються з важкими рішеннями, як в особистому житті, так і в операційній. Вони повинні боротися з етичними дилемами, вибором, що змінює життя, і суворими реаліями медичної професії. У всьому цьому вони спираються один на одного за підтримкою, розуміючи, що Меморіал Грей Слоун - це більше, ніж просто робоче місце, це сім'я.