У 3 сезоні серіалу «Темні матерії» продовжується історія відважної дівчинки на ім'я Ліра та близьких до неї людей. У цьому розділі центральній героїні доводиться мати справу з роллю месії, яку на неї покладає пророцтво відьом. Згідно з ним, Ліра має стати новою Євою, дії якої вплинуть на долю всього людства. Міс Коултер хоче уберегти свою дочку від виконання будь-якого з варіантів пророцтва. Щоб забезпечити цей захист, вона викрадає дівчинку і тримає її поруч із собою, постійно накачуючи препаратами, щоб вона не втекла. Вілл блукає світами у пошуках своєї викраденої подруги. Два ангели, які подорожують із ним, незабаром допомагають йому знайти дорогу до Ліри. Тим часом лорд Азріель веде відкриту війну проти Бога, який сконцентрував у руках владу над розумними істотами у всіх об'єднаних світах. У кожному з них є свій аналог Магістеріуму. Азріель об'єднує всіх тих, хто постраждав від гніту Володаря і хоче жити вільним життям. До нього приєднуються навіть деякі ангели. Єдиний спосіб знищити Бога – скористатися Тонким ножем. Проте, артефакт ще необхідно знайти і зберегти.