У другому сезоні "Монка" геніальний, але нав'язливий детектив Едріан Монк продовжує розкривати заплутані злочини, водночас борючись зі своїми особистими демонами. Коли колишня асистентка Монка, Шарона, звільняється, її місце займає нова медсестра на ім'я Наталі. Незважаючи на початкові розбіжності, Наталі виявляється цінним помічником Монка у розкритті злочинів. Разом вони розслідують різноманітні справи, зокрема вбивство за допомогою викраденого лотерейного квитка та, здавалося б, неможливе самогубство. Монк також стикається з викликами поза межами своєї детективної роботи, наприклад, відвідує зустріч сім'ї та бореться зі спогадами про смерть дружини, що переслідують його. Протягом усього сезону надзвичайна увага Монка до деталей і його здатність бачити те, чого не помічають інші, наближають його до розкриття істини в кожній справі. Однак його нав'язлива потреба в порядку і чистоті часто заважає йому просуватися вперед і ставить під загрозу його власну безпеку. Коли Монк протистоїть своїм страхам і бореться з власними тривогами, він доводить, що іноді навіть найбільш пошкоджені люди можуть знайти справедливість і спокуту.