"Темні води" - юридичний трилер, заснований на реальних подіях. Фільм розповідає про Роберта Білота, корпоративного адвоката, який береться за екологічний позов проти DuPont, однієї з найбільших хімічних компаній у світі.
У позові, поданому від імені фермера із Західної Вірджинії, стверджується, що DuPont забруднює землю фермера та отруює його худобу токсичною хімічною речовиною, відомою як PFOA. Розслідуючи справу, Білотт виявляє, що компанія DuPont знала про небезпеку PFOA протягом десятиліть, але приховувала цю інформацію від громадськості.
Пошуки Білоттом правди наражають його та його сім'ю на небезпеку, оскільки DuPont використовує всі свої ресурси, щоб спробувати дискредитувати його. У міру того, як справа затягується, Білотт стає все більш одержимим викриттям правди і притягненням DuPont до відповідальності за свої дії.