Серце Гакаби розповідає ексцентричну історію Альберта Марковського, екологічного активіста, який дедалі більше розчаровується у своєму житті і шукає відповіді на екзистенційні питання, що мучать його. Він наймає пару екзистенціальних детективів, Бернарда і Вівіан Джаффе, щоб ті розслідували його існування і спрямували його до просвітлення. Заглиблюючись у життя Альберта, детективи розкривають павутиння взаємопов'язаних стосунків і зустрічей, зокрема з французькою нігілісткою на ім'я Катрін Вобан. Пошуки відповідей приводять Альберта до зустрічей з різними колоритними персонажами, зокрема з керівником-конкурентом мережі універмагів Huckabees, яка уособлює споживацтво і поверховість. Протягом усього фільму герої беруть участь у філософських дебатах і сюрреалістичних переживаннях, розмиваючи межі між реальністю і фантазією. Поки Альберт бореться зі своєю екзистенційною кризою, фільм досліджує теми ідентичності, взаємопов'язаності, споживацтва та пошуку сенсу в хаотичному світі.