У далекій-далекій галактиці мирна планета Набу опинилася під загрозою з боку зловісної Торгової Федерації, яка заблокувала планету з метою залякування. Лицарі-джедаї Квай-Гон Джинн та Обі-Ван Кенобі вирушають на місію, щоб домовитися про мирне врегулювання. Однак вони виявляються втягнутими в небезпечну змову, організовану таємничим лордом ситхів Дартом Сідіусом. Разом з ними вони зустрічають юнака на ім'я Енакін Скайвокер, який має сильний зв'язок з Силою. Розпізнавши його потенціал, джедаї беруть його з собою у подорож.
Квай-Гону та Обі-Вану, які намагаються зорієнтуватися у підступному політичному кліматі, допомагає досвідчена пілотеса на ім'я Падме Амідала, замаскована під королеву Набу. Разом вони здійснюють зухвалу втечу, зриваючи плани Торгової Федерації та рятуючи полонених мешканців Набу.
Джедаї знаходять притулок на планеті Татуїн, де зустрічають родину Енакіна. Визнавши природний талант Енакіна, Квай-Гон вірить, що він може стати пророченим обранцем, який принесе рівновагу в Силу. Тим часом Рада джедаїв, остерігаючись віку Енакіна та його прив'язаності, не бажає навчати його джедайству.
Коли доля Набу висить на волосині, джедаї та їхні союзники розробляють план саботажу контролю Торгової Федерації, беручи участь у захоплюючій та насиченій битві. Серед хаосу Квай-Гон вступає у смертельний двобій з учнем ситхів Дартом Молом, що свідчить про повернення ситхів, які вважалися вимерлими.
"Зоряні війни: Епізод I - Прихована загроза" розплутує складну павутину політичних інтриг, представляючи таких культових персонажів, як королева Амідала та пустотливий гунган Джа Джа Бінкс. Фільм слугує прелюдією до улюбленої саги "Зоряні війни", заглиблюючись у походження Енакіна Скайуокера, піднесення темної сторони та початок епічної подорожі, яка назавжди сформує галактику.