У "Людях Ікс 3: Остання битва" напруга зростає, коли "ліки" від мутацій загрожують знищити існування Людей Ікс. Вболіваючи за свій рід, професор Ксав'єр та його команда стикаються з важким рішенням. Тим часом Джин Грей, яку вважали мертвою, з'являється як могутній і мінливий Фенікс, що намагається контролювати свої величезні сили. Коли старі альянси випробовуються і розпадаються, Люди Ікс мусять обрати сторону. Магнето вважає, що ліки - це замах на їхню ідентичність, і розпочинає тотальну війну проти людства. Люди Ікс на чолі з Росомахою намагаються зупинити його і врятувати Джин від її руйнівного шляху. Відбувається вирішальна битва, в якій мутант проти мутанта, і яка створює підґрунтя для протистояння, що змінює життя. Приносяться жертви, руйнуються союзи, і мутанти мусять змиритися з наслідками свого вибору. Зрештою, Люди Ікс долають величезні труднощі, але ціна цього залишає тривалий вплив на світ мутантів, назавжди змінюючи динаміку відносин між людьми та мутантами.