У 3 сезоні серіалу «Нарко» історія зміщує свій фокус із Пабло Ескобара, історія переслідування якого завершилася, на інших наркоторговців, які продовжують провадження своєї діяльності. Йдеться про наркокартеля Калі та його ватажків. Це чотири хрещені батьки, кожен з яких веде справи дещо по-своєму. Змінився і той герой, метою якого є протидія цим злочинцям. На зміну Стіву Мерфі прийшов чоловік на ім'я Пенья. Він працює дещо інакше, хоча часом і наштовхується на ті самі проблеми, з якими мав справу його попередник. Події цього сезону переважно розвиваються в Колумбії, як і раніше, але також зачіпають інші місця. Один із героїв одного разу вирушає до Мексики, щоб зустрітися там із людиною, яка носить дивне ім'я. Інший учасник подій виконує завдання в Нью-Йорку, де він наражається на великий ризик викриття внаслідок нещасного випадку. Пенья старанно збирає сили та можливості, щоб усунути лідерів Калі. Це буде дуже непросто, особливо з огляду на перевагу взяття їх живими.