Події розгортаються навколо Нільса Хольгерсона, неслухняного хлопчика, який живе на фермі на півдні Швеції. Одного разу він спіймав томте, чарівну істоту зі скандинавського фольклору, і намагається його катувати. Томте, щоб помститися, зменшує Нільса до розміру великого пальця і наділяє його здатністю спілкуватися з тваринами. Нільс рятується від розлючених тварин, вчепившись за шию Мартіну, домашньому гусаку, який хоче приєднатися до зграї диких гусей, що пролітають над фермою. Ватажок диких гусей Акка неохоче погоджується взяти Нільса і Мартіна з собою за умови, що вони доведуть, що гідні бути частиною зграї. Так починається дивовижна пригода для Нільса, який подорожує з гусями через усі провінції Швеції, від Сконе до Лапландії.