Вчені стурбовані зростанням випадків мутацій, коли в різних куточках світу кожен новий "людина-мутант" проявляє індивідуальні здібності. З'являється питання: чи це нова форма життя на Землі, чи еволюційний процес? Ці унікальні особи здебільшого стають відстороненими від суспільства через свої особливості. Але вчений Чарльз Ксав'є входить в гру, беручи мутантів під свою опіку та навчаючи їх у спеціальній школі, щоб перетворити на загін, що бореться за порядок і справедливість. Ксав'є, сам мутант телепат, намагається навести гармонію. Однак все змінюється, коли інший мутант, Магнето, збирає свою армію молодих мутантів з іншими цілями — завоювати й підкорювати світ. Люди Ікс, під керівництвом Ксав'є, вступають в війну проти "зловживань" мутантів, розкриваючи протистояння між двома групами.