У другому сезоні «Бальтазара» Рафаель Бальтазар продовжує допомагати детективу Елен Бах у розкритті низки заплутаних і похмурих справ про вбивства в Парижі. Сезон заглиблюється в особисте життя Бальтазара та його нав'язливу одержимість нерозкритим вбивством його дружини Лізи. У міру розгортання нових справ, від загадкових утоплень до моторошних вбивств, нетрадиційні криміналістичні методи Бальтазара та його здатність спілкуватися з померлими залишаються ключовими у розслідуванні. Однак його починають наздоганяти особисті демони, які штовхають його до саморуйнівної поведінки.