Третій і останній сезон «Ганнібала» починається з Вілла Ґрема та Ганнібала Лектера після подій попереднього сезону. Двох чоловіків переслідує ФБР під керівництвом Джека Кроуфорда, коли вони подорожують Європою та беруть участь у серії ігор у кішки-мишки. Сезон також заглиблюється в минуле кількох головних персонажів і стосунки між ними.