У дванадцятому сезоні ніндзя беруть участь у грі віртуальної реальності під назвою Prime Empire. Вони змагаються з іншими гравцями у пошуках Ключів-Танів, могутніх предметів, які можуть відкрити велику силу. Однак незабаром вони виявляють, що гра - це не просто невинне змагання. Лиходій на ім'я Унаґамі прагне втекти з віртуального світу і взяти під свій контроль Ніндзяґо. Ніндзя мусять долати складні рівні, розв'язувати головоломки та протистояти власним бажанням, щоб зупинити Унаґамі та врятувати цифровий і реальний світи від знищення.