У шостому сезоні "NCIS: Полювання на вбивцю" на команду чекає ще один рік складних розслідувань. Гіббс, досвідчений колишній морський піхотинець, продовжує керувати командою зі своїм безкомпромісним підходом. Сезон розпочинається з наслідків терористичної атаки на рідне місто Гіббса, що підштовхує його до пошуку відповідей і справедливості. Полюючи на злочинців, команда викриває мережу корупції та зради в армії.
Протягом сезону команда стикається з різноманітними справами - від убивств і шпигунства до викрадень і міжнародних оборудок зі зброєю. Вони розплутують таємницю смерті офіцера, що приводить їх до таємного товариства зі смертельними наслідками. Команда також розслідує вбивство лейтенанта ВМС, виявляючи зв'язок із невловимим торговцем зброєю. Тим часом справа про зникнення морського піхотинця виводить їх на небезпечну мережу з експлуатації дітей.
Під час розслідування команда стикається з особистими проблемами та конфліктами. Тоні бореться зі своєю відданістю роботі, коли отримує пропозицію від ФБР, що змушує його зробити вибір між вірністю колегам і власним майбутнім. Лояльність Зіви піддається випробуванню, коли її батько, високопоставлений ізраїльський чиновник, виявляється вплутаним у змову з метою вбивства. Крім того, з'являється старий друг Гіббса, який має особисту помсту команді.
Напруга зростає, і команда бореться проти часу, покладаючись на свою згуртованість і досвід, щоб розкрити справи і притягнути винних до відповідальності. Пройшовши через злети і падіння, вони доводять, що їхня відданість місії та один одному залишається непохитною. Захоплюючі розслідування, складні стосунки та неочікувані повороти - шостий сезон "Морської поліції" тримає глядачів у напрузі.