У дванадцятому сезоні "Мовчазного свідка" команда судово-медичних патологоанатомів Центру Лайєлла стикається з низкою складних і заплутаних справ. Доктор Ніккі Александер та її колеги, доктор Гаррі Каннінгем і доктор Лео Далтон, розслідують підозрілі смерті і розплутують правду, що стоїть за кожною трагедією.
Сезон розпочинається із захопливого двосерійного епізоду, де команда розкриває похмуру таємницю, поховану у світі змагального веслування. Заглиблюючись у розслідування, вони виявляють павутину брехні, зради та вбивств, яка загрожує розірвати престижну спортивну спільноту.
В іншому випадку команда розслідує загадкову смерть молодої жінки, знайденої у Темзі. Незважаючи на брак доказів, вони підозрюють нечесну гру і змагаються з часом, щоб розплутати обставини її смерті, перш ніж ще більше життів опиняться під загрозою.
Фатальна автомобільна аварія змушує команду запідозрити, що це був не нещасний випадок. Копаючи глибше, вони виявляють зв'язок між жертвою та безжальною бандою, що веде їх до розкриття зловісної змови, яка загрожує далекосяжними наслідками.
Команда також стикається з жахливою реальністю експлуатації дітей, коли в неглибокій могилі знаходять тіло дівчинки. Невтомно працюючи над ідентифікацією жертви та упійманням злочинця, вони стикаються з несамовитою правдою темного світу торгівлі дітьми.
Протягом усього сезону особисті та професійні виклики впливають на динаміку команди. Ніккі стикається з власними демонами, коли спливає її минуле, а Гаррі бореться з етичною дилемою суперечливого медичного випробування. Лео, з іншого боку, стикається з власною смертністю, коли у нього діагностують хворобу, що загрожує життю.
Протягом усього серіалу команда залишається непохитною у своєму прагненні до справедливості та встановлення істини. З кожною справою вони розширюють межі судово-медичної науки, щоб наблизити заспокоєння для жертв та їхніх близьких, навіть незважаючи на неймовірні перешкоди та особисті жертви.