У 13-му сезоні "Губки Боба Квадратні Штани" мешканці Бікіні Боттом вирушають у захопливі пригоди та стикаються з новими викликами.
Сезон починається з того, що Губка Боб бере на себе роль супергероя на ім'я "Квікстер", щоб захистити місто від лиходіїв. Тим часом Сквідвард відкриває в собі прихований кулінарний талант і відкриває власний фургончик з їжею, що призводить до несподіваного успіху.
Коли містер Крабс впроваджує новий додаток для економії грошей у "Красті Краб", це створює хаос серед працівників, які намагаються йти в ногу з технологічними змінами. Губка Боб, який є технологічно обмеженим, опиняється в кумедній боротьбі за адаптацію.
З наближенням літа Губка Боб організовує підводний пляжний фестиваль, на який збирається все місто, щоб повеселитися на сонці. Але все змінюється, коли дике морське чудовисько спричиняє хаос, загрожуючи святу. Чи зможуть Губка Боб і його друзі врятувати ситуацію?
Пізніше Планктон представляє свій останній винахід - дублюючий промінь, сподіваючись нарешті викрасти секретну формулу "Краббі Петті". Однак його плани руйнуються, коли він випадково клонує самого себе, що призводить до хаотичного та комедійного ланцюга подій.
В іншій серії Сенді запрошує своїх друзів до Техасу на родео. Губка Боб і Патрік намагаються вразити ковбоїв своїми "вестерн" навичками, але в підсумку створюють більше проблем, ніж очікували.
Наприкінці сезону банда вирушає на пошуки підводних скарбів, коли знаходить карту, що веде до захованих скарбів. Їхні пошуки ведуть до таємничих місць, боротьби з піратами та несподіваних випробувань, і все це в пошуках головного скарбу.
У фінальній серії сезону зникає улюблений домашній равлик Губки Боба, Гарі. Вирішивши знайти його, Губка Боб і Патрік вирушають в емоційну і зворушливу подорож, яка перевіряє їхню дружбу і вчить їх справжньому значенню товариських відносин.
Протягом усього 13-го сезону "Губки Боба Квадратні Штани" на глядачів чекає чудова суміш гумору, пригод і цінних життєвих уроків, коли улюблені герої прокладають свій шлях через химерний світ Бікіні Боттом.