У четвертому сезоні "Губки Боба Квадратні Штани" мешканці Бікіні Боттом поринають у ще більш веселі та дивакуваті пригоди. Губка Боб потрапляє в подорож у часі під час доставки піци і випадково змінює минуле, створюючи хаос у теперішньому. Він також винаходить техніку надування мильних бульбашок, яка вражає всіх і призводить до того, що його надувний друг Бабл Бадді стає місцевою знаменитістю.
Найкращий друг Губки Боба, Патрік, знаходить рідкісну картку, що коштує цілий статок, і втягується в небезпечну та комічну гонитву за нею, щоб захистити її від злодіїв. Тим часом містер Крабс запроваджує новий пункт меню у "Красті Краб", який називається "Краббі О'Понеділок", що призводить до епідемії "понеділкової хвороби" серед відвідувачів.
Сквідвард, сварливий сусід Губки Боба, за одну ніч стає музичною сенсацією, коли його гра на кларнеті загадковим чином покращується. Однак незабаром він відкриває для себе зворотний бік слави і намагається впоратися з нав'язливими шанувальниками. Губка Боб допомагає Сквідварду усвідомити цінність бути вірним собі.
Планктон, ресторатор-конкурент, продовжує свої невпинні спроби викрасти секретну формулу "Крабової котлети". Він маскується під містера Крабса, щоб виманити у Губки Боба рецепт, але його плани неодноразово зазнають краху через власну недолугість.
В одному з епізодів на Бікіні-Боттом опускається таємничий туман, через що всі втрачають пам'ять. Губка Боб береться допомогти мешканцям відновити пам'ять, що призводить до веселих витівок і несподіваних одкровень. А коли в мирне містечко вторгається банда байкерів, Губка Боб, Патрік і Сенді створюють власну веселу байкерську банду, щоб захистити своє улюблене Бікіні Боттом.
Протягом усього четвертого сезону "Губки Боба Квадратні Штани" глядачі насолоджуються чудовими та дивакуватими пригодами улюблених підводних героїв, сповненими гумору, життєвих уроків та міцної дружби, яка визначає улюблений серіал.