У другому сезоні серіалу «По той бік» продовжується дослідження паралельних світів та їхніх складних взаємозв'язків. Після закриття переходу між світами Говард Сілк з Альфа-світу опиняється у в'язниці «Ехо» в Прайм-світі, де його піддають допитам і змушують переосмислити своє життя та стосунки з дружиною Емілі. Тим часом Говард Прайм бере на себе роль свого двійника в Альфа-світі, намагаючись підтримувати видимість нормального життя, водночас розслідуючи діяльність підпільної організації «Індіго», яка загрожує обом світам.
У цьому сезоні з'являється новий персонаж — Ная Темпл, колишня агентка ФБР, яку наймають для виявлення сплячих агентів «Індіго» в Альфа-світі. Вона співпрацює з Пітером Квейлом, який намагається приховати таємницю своєї дружини Клер, що виявляється агенткою з Прайм-світу. Клер стикається з внутрішнім конфліктом між лояльністю до «Індіго» та почуттями до своєї нової сім'ї.
Серіал заглиблюється в історію створення паралельних світів, розкриваючи, що вони виникли внаслідок наукового експерименту в 1987 році, який пішов не за планом. Це призвело до існування двох реальностей, які спочатку були ідентичними, але з часом почали відрізнятися через різні події, зокрема пандемію в Прайм-світі.
Говарди з обох світів змушені пристосовуватися до нових обставин, приймаючи риси характеру один одного. Вони стикаються з моральними дилемами, питаннями довіри та зрадництва, намагаючись запобігти конфлікту між світами та зупинити плани «Індіго». Сезон завершується напруженим протистоянням, яке ставить під загрозу долю обох реальностей.
«По той бік» продовжує досліджувати теми ідентичності, вибору та наслідків наших дій, підкреслюючи, як навіть незначні рішення можуть вплинути на хід історії.